在东京的不起眼角落，园田真理、菊池启太郎的侄子条太郎、海堂直也和草加雅人联手经营着“菊池西洋洗涤铺”，为俄尔以诺提供庇护。然而，政府重组后的智脑公司却变成了一家旨在消灭俄尔以诺的组织，由北崎领导。某天，草加和海堂化身为假面骑士凯撒和蛇俄尔以诺，为了拯救被追杀的同伴而与消灭俄尔以诺小队的队长胡桃玲菜对抗。突然间，多年失踪的乾巧现身，以全新形态——假面骑士次世代555（暂译）的身份，作为智脑公司的头号战力出现在战场上。